Hola fjanula,
Es mejor que esperes un tiempo, antes de usar ffmpeg seriamente.
ffmpeg tiene muchos bugs, y a la verdad es que solo sirve para experimentar.
Ademas, no te sirve para sustituir a DVD Shrink, ya que solamente hace MPEG-1.
La version actual genera muchisimos errores de multiplexeo. Y aunque lo de-multiplexees y re-multiplexees tu MPEG con BBMpeg o cualquier otro multiplexeador, como quiera te quedan medios mal los mpegs
Asi que por ahora, yo solo hago pruebas con ffmpeg, pero nungun encode completo.
-kwag