É pra marcar quando o DVD de origem for PAL e vc tiver certeza que trata-se de conteúdo progressivo. Portanto a não ser que vc tenha algum DVD importando da Europa, deixe a caixa desmarcada. Isso foi necessário pq alguns DVDs PAL progressivos por algum motivo que escapa a minha compreensão tem o flag "Progressive Frames" desabilitado, mas é progressivo.
Só que o DIKO Free não suporta conteúdo entrelaçado mesmo então não faz muita diferença vc marcar ou não.
Eu vou desabilitar essa caixa na proxima versão do DIKO Free para evitar confusão.
No DIKO mais recente tem a caixa Progressive para o projetod2v, e no readme diz:
