Hola Ginger, hasta donde sé creo que te podré orientar:
El método express lo que hace es obtener un archivo m2v y otro mp2 (o bien deja el audio en ac3 a gusto del consumidor) para dárselos a un programa de autoría de DVDs y que éste te haga una estructura de dvd a quemar con tu programa favorito de grabación de dvds. Esto es así porque parece que la mayoría de programas de autoría prefieren audio y video por separado que juntos, ya que luego la mayoría los separan.
Ahora bien, con los subtitulos pasa lo siguiente:
Tal cual está el método ahora mismo los subtítulos quedan "incrustados" en el video, es decir, lo mismo que hacíamos siempre con los kvcds y tmpgenc. Con lo cual no se puede tener más de un subtítulo.
Existe otra posibilidad que es tener varios subtítulos y que además no estén incrustados en el video, sino que estén como en un dvd original, con la posibilidad de visionar el que quieras. Esta opción se consigue pasando con Subrip todos los subtítulos que quieras a un formato que sea compatible con el programa de autoría que te genere la estructura de dvds, y entonces se los colocas junto con el m2v y el mp2 y tendrás una peli con varios subtitulos a seleccionar el que quieras. El único problema que le encuentro a esta opción es que el único programa que conozco que te permita insertar varios subtitulos es el dvdmaestro y la verdad es que es bastante complicado de usar, a la vez que muy exigente con el archivo de video (si no es super standar o tiene algun error no lo acepta).
Yo he optado por la primera opción, incrustando en el video los subtitulos forzados y usando tmpg dvd author como programa de autoría ya que es el más sencillo de usar, aunque un poco limitado en virguerías. Si quieres más potencia usa dvdlab pero no admite tampoco subtitulos como tu quieres.
Bueno, espero haberte ayudado y si en algo me he equivocado seguro que algun maestro nos echa una mano.
Suerte.